Κάθε φοιτητής είναι υποχρεωμένος να εκπονήσει πτυχιακή εργασία μετά το πέρας του ΣΤ' εξαμήνου και εφόσον έχει παρακολουθήσει με επιτυχία 31 επί συνόλου 39 μαθημάτων με εξαίρεση τα προαιρετικά μαθήματα Ξένη Γλώσσα Ι, ΙΙ και ΙΙΙ , Εφαρμογές Πληροφορικής στην Τεχνολογία Τροφίμων και Σύνταξη Τεχνικών Εκθέσεων.

Φοιτητής ο οποίος καταθέτει αίτηση για εξέταση πτυχιακής εργασίας , θα πρέπει να έχει περάσει το μάθημα "ΣΕΜΙΝΑΡΙΟ".

Σύμφωνα με απόφαση της Γενικής Συνέλευσης του Τμήματος, η Πτυχιακή Εργασία απαραίτητα πρέπει, να έχει ερευνητική μορφή, να περιλαμβάνει κριτική ανασκόπηση της βιβλιογραφίας και πειραματικό μέρος. Η χρονική διάρκεια εκπόνησης της, ορίζεται από ένα μέχρι τρία εξάμηνα. Η παρουσίαση - εξέταση της Πτυχιακής Εργασίας γίνεται παρουσία ακροατήριου, αποτελούμενο από την τριμελή εξεταστική επιτροπή, από το Εκπαιδευτικό Προσωπικό του τμήματος και τους φοιτητές.

Η μορφή των πτυχιακών θα είναι : 3 cd για τη γραμματεία εάν την πτυχιακή την έχει ένας φοιτητής , 4 cd εάν την έχουν δύο φοιτητές και για τα άλλα 3 αντίγραφα των εξεταστών ( cd ή βιβλίο)  σε συνεννόηση με τον επόπτη καθηγητή.
Κάθε  cd να είναι σε χάρτινη θήκη με τυπωμένο  το θέμα της πτυχιακής εργασίας στα ελληνικά και αγγλικά, καθώς και τα ονόματα των καθηγητών και των φοιτητών.